Ukmergės miesto ir rajono pagrindinės mokyklos, kurių ugdytiniai pasirenka tęsti mokymąsi Jono Basanavičiaus gimnazijoje. Pagrindinių mokyklų mokiniams organizuojami įvairūs renginiai: protų mūšiai, viktorinos, varžybos, konkursai, atvirų durų dienos, kurių metų jie gali susipažinti su gimnazijoje vykdoma veikla, mokytojais, gimnazistais.

Dr. Jono Basanavičiaus vardo mokyklos. Lietuvoje yra dar 4 mokyklos, pavadintos patriarcho vardu:
Vilniaus Jono Basanavičiaus gimnazija
Vilniaus Jono Basanavičiaus progimnazija
Kauno Jono Basanavičiaus gimnazija
Bartninkų Jono Basanavičiaus vidurinė mokykla
Kartu susitinkame Signatarų namuose ir ten organizuojamuose patriarcho jubiliejuose, pažymime Lietuvos valstybingumo dienas. 2011m.Vilniuje Jono Basanavičiaus vardo mokyklos pasirašė bendradarbiavimo sutartį.

Vilniaus universitetas.
2009 m. sausio 8 d. Vilniaus universiteto Rektoriaus auloje Ukmergės rajono savivaldybės meras Algirdas Kopūstas ir Vilniaus universiteto rektorius akademikas Benediktas  Juodka pasirašė bendradarbiavimo sutartį. Taip pat pasirašyta sutartis tarp Vilniaus universiteto ir Ukmergės Jono Basanavičiaus gimnazijos. Šiomis sutartimis šalys  siekia plėtoti bendrą ateities viziją atitinkantį bendradarbiavimą, siekti sukurti išsimokslinusią, kūrybišką, modernią ir pilietišką bendruomenę, susitaria įgyvendinti abipusiai naudingą bendravimo politiką, nukreiptą į Universiteto studijų programų ir Ukmergės darbo rinkos poreikių ir interesų suderinimą, remti Universiteto bendruomenės ir Ukmergės atstovų ryšius, formuojant miesto pažangai aktualių mokslinių tyrimų tematiką, remti iniciatyvas, atveriančias galimybes įsijungti į tarptautines programas ir įgyvendinti konkrečius projektus, keistis informacija, remti specialistų profesinės kvalifikacijos kėlimą ir tęstinį mokymą, sudaryti sąlygas Universiteto studentams atlikti praktiką Ukmergės mieste, plėtoti kultūrinį bendradarbiavimą. Sutarties pasirašymo ceremonijoje dalyvavo savivaldybės administracijos direktorius Juozas Varžgalys,  Švietimo ir sporto skyriaus vedėja Dalė Steponavičienė, Jono Basanavičiaus gimnazijos direktorius Valentinas Gendvilis, gimnazijos moksleivių prezidentė Viktorija Biveinytė.
Kartu su VU vykdoma nemažai profesinio informavimo veiklų: VU dienos gimnazijoje, gimnazistai kasmet vyksta į atvirų durų dienas, ekskursijas po VU biblioteką, fakultetus, kasmet dalyvaujame VU „Tyrėjų naktyse“.